紫光电子所隶属的紫光集团，前身是成立于1988年7月的清华大学科技开发总公司， 是经原国家教委批准， 由清华大学主办， 全民所有制的科技先导型校办高新技术企业集团。 1993年4月， 清华大学科技开发总公司改组成立清华紫光(集团)总公司， 主办单位仍为清华大学。 清华控股有限公司成立后， 紫光集团的股权全部划拨至清华控股有限公司，清华控股有限公司成为紫光集团的全资控股股东。 截至2007年12月31日， 紫光集团总资产为13.6亿元， 合并营业收入为6.7亿元， 是清华控股有限公司下属的重点企业之一。 北京清华紫光电子公司，成立于1992年8月，为清华紫光集团公司的全资下属公司，在集团公司的领导下，通过不懈努力， 公司从中关村一家不知名的小公司发展成长为国内知名的IT企业。深圳市紫光平安技术有限公司是紫光电子在深圳的机构。