桂林航空有限公司由桂林旅游发展总公司和桂林航空旅游集团有限公司共同出资组建，注册资本为人民币6亿元，桂林旅游发展总公司以现金出资人民币3.6亿元，占注册资本的60%；桂林航空旅游集团有限公司以现金出资人民币2.4亿元，占注册资本的40%。